在食用菌出菇旺期和出菇后期，培養料中的養分消耗殆盡，此期及時追施肥料，能顯著提高食用菌的產量，改善品質。肥料配制建議如下操作：
糞土肥
將曬干的豬、牛糞粉碎，用石灰水上清液預濕堆制15天，加50％的肥泥和少量草木灰拌勻，在食用菌產量急劇下降或出現死菇時，清理床面，剔除老根，將糞土肥撒施于床面。草料汁 用腐熟曬干的草料，加100倍水煎取汁液，冷卻后噴灑，可使食用菌生長健壯。棉子汁 將棉子加10倍水煎汁，冷卻后加3倍清水施用。
食品液
取10公斤沒有霉變的黃豆，淘洗干凈，浸泡后加水50～60公斤，煮后濾取湯汁，加水至200公斤噴灑；取10公斤胡蘿卜切碎，加15公斤水，煮30分鐘，過濾取汁，加3倍水配成25％的胡蘿卜汁噴灑；在100公斤水中加入固體葡萄糖1公斤，溶化后即得1％的葡萄糖液，直接噴灑即可。
菇根湯 取菇根5～10公斤，冼凈，加水10～15公斤，煮沸15分鐘，取清液加水50公斤，攪勻后噴施，可促進菇蕾生長。
上述各種追肥液每平方米用量0.5公斤左右。
